I problemi attuali della direzione spirituale includono la difficoltà di trovare direttori qualificati e disponibili, la tendenza a sostituire la guida spirituale con consulenze superficiali o spiritualità fai-da-te, e la sfida di integrare un percorso spirituale in una vita moderna frenetica e complessa. Altri problemi possono essere la mancanza di chiarezza nel ruolo del direttore spirituale, la sostituzione di consigli spirituali con sostituzioni in scelte personali e la difficoltà nel gestire i conflitti tra le richieste di preghiera e impegni della vita quotidiana.