Drupadi berisi dua kisah terpisah, tetapi saling berhubungan. Bagian pertama berisi kisah-kisah tragedi kemanusiaan tahun 1965, yang sampai sekarang menyisakan luka dan trauma. Kisah-kisah ini ditulis berdasarkan hasil riset bertahun-tahun dengan mengumpulkan kesaksian para saksi mata, untuk kemudian diungkapkan dalam bentuk sastra. Bagian Tragedi ini dihadirkan penulis sebagai upaya mendorong satu proses rekonsiliasi yang diprakarsai negara. Dendam yang mengendap sejak 50 tahun lalu, diharapkan terkikis, dan kita melangkah mantap sebagai warga negara yang tidak saling menyimpan luka. Bagian kedua menyusup pada ajaran karma dan reinkarnasi. Karma menjadi catatan buku besar negeri langit yang dipercaya sebagai penyebab dari kehidupan manusia setelah mati dan dilahirkan kembali. Reinkarnasi selalu membawa akibat dari karma terdahulu. Bagian Reinkarnasi ini menunjukkan keseriusan penulis melakukan riset dan mengaitkannya dengan pencapaian ilmu penyembuhan (kedokteran), yang disebut teori regresi. Para tokoh dalam kisah pada bagian ini, memberi kesaksian tentang dirinya yang pernah menjadi seseorang yang lain di masa lalu. Penulis secara unik membiarkan tokoh-tokoh yang sebenarnya sudah meninggal atau mengalami inkarnasi menjadi makhluk lain, menceritakan kehidupannya sendiri.